Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms