Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms