Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOP08100 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOP08100 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOP08100 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms