Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTMAP06454 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTMAP06454 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTMAP06454 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTMAP06454 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTMAP06454 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTMAP06454 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTMAP06454 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTMAP06454 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTMAP06454 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTMAP06454 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTMAP06454 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTMAP06454 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTMAP06454 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTMAP06454 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTMAP06454 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTMAP06454 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTMAP06454 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTMAP06454 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms