Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms