Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms