Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms