Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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