Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms