Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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