Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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