Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms