Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms