Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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