Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms