Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms