Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PADI4Q9UM07 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PADI4Q9UM07 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PADI4Q9UM07 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PADI4Q9UM07 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PADI4Q9UM07 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PADI4Q9UM07 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PADI4Q9UM07 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PADI4Q9UM07 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PADI4Q9UM07 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PADI4Q9UM07 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PADI4Q9UM07 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms