Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms