Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms