Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms