Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMEM248Q9NWD8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM248Q9NWD8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM248Q9NWD8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM248Q9NWD8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM248Q9NWD8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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