Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms