Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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