Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2Q9BX26 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms