Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms