Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms