Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms