Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP9Q99956 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms