Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms