Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms