Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms