Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAMBPL1Q96FJ0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms