Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms