Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC9Q8NEP7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms