Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms