Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms