Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8N402 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8N402 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8N402 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8N402 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8N402 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8N402 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8N402 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N402 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms