Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms