Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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