Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms