Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms