Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms