Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMBQ6PCB8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms