Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms