Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFT2D3Q587I9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFT2D3Q587I9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFT2D3Q587I9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFT2D3Q587I9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFT2D3Q587I9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFT2D3Q587I9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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