Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms