Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KIAA1644Q3SXP7 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KIAA1644Q3SXP7 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms