Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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