Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms