Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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